我院在科学研究方面形成了一批长期稳定的有特色的科研方向：微分方程数值方法及应用、微分方程理论、李群李代数、矩阵分析及应用、流体数值模拟及应用、函数论与分形几何、生物计算、随机过程及应用等，具有雄厚的科研实力和较高的学术水平，主持了一大批国家级及省部级科研项目，取得了一批高水平的科研成果，在国内外产生了一定影响，部分已达到或接近国际先进水平。

     2000年来，主持或参加国家杰出青年科学基金项目、国家973项目子课题、863子课题、国家自然科学基金重点项目、国家自科基金委和德国科学基金合作项目及国家重大专项子课题等国家级项目80余项；主持教育部创新团队项目、省自然科学基金创新群体项目、省高校科技创新团队项目、国防预研基金项目、教育部重点项目、教育部博士点基金等省部级项目84项；其他课题100余项，总经费3400余万元。获教育部自然科学一等奖、省自然科学一等奖各类省部级科技奖12项；出版专著12部，在国内外重要刊物或学术期刊上发表论文1000余篇，其中SCI(E)、EI、ISTP收录600余篇，承办和筹办学术会议33次，其中国际会议5次。